消費者庁のガイドラインでは、機能性表示食品の「食品の区分」として、加工食品（サプリメント形状）、加工食品（その他）、生鮮食品が示されています。それぞれ制度が発足した2015年度から2023年度（2024年3月末）までに届出公表された件数（割合及びそのうちの撤回件数）は、次のとおりです。

これらのうち、加工食品（その他）には様々な形態の食品が含まれています。ここでは、消費者庁の「機能性表示食品の届出情報検索」サイトの情報を基に、機能性関与成分を含む原材料が農林水産物の生鮮品または1次加工品のみと推定される届出件数（計682件）について図のようにまとめました。1次加工品には、乾物、粉末、ペースト、ジュース（果汁）、茶等を含め、参考として原材料が酢、植物油についても掲載しました。

また、生鮮食品の届出件数（計232件）についても図2のように届出件数の推移をまとめました。図3はその分類別届出件数を示しています。